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论文的查重通常是通过使用专门的查重软件来进行的。查重软件对论文中的文字进行比对，将其与已有的文献库或互联网上的内容进行对比，以检测相似部分和重复部分。
具体的查重算法可能因软件而异，但一般来说，以下几个方面会被考虑：
1.直接复制：查重软件会比对论文中的文字与已有的文献库或互联网上的文字进行比对，检测出直接复制的部分。
2.同义词替换和改写：查重软件还会检测论文中的同义词替换和改写。即使换了几个词语，但意思和表达方式相似的部分仍然会被检测出来。
3.引用和参考文献：查重软件通常会将引用和参考文献排除在外。引用的内容不会被视为重复，但会被标注出来。
总之，查重软件只能提供初步的结果，最终的判断仍需要人工审查。有时候，查重软件可能会误报一些相似的内容，而一些合法的引用和文献可能会被错误地视为重复。因此，在进行最终判断之前，作者还应该自行审查论文中的相似部分，确保没有不当的抄袭行为。
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