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陈骨和烧骨DNA提取的法医学鉴定探讨论文

发布时间:2024-03-11 09:37:38 文章来源: SCI论文网 我要评论














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  摘要:骨是由骨组织、骨膜和骨髓等构成的坚硬器官,在机体中主要起支持、运动和保护作用,骨中含有大量钙、磷等矿物质。骨骼组织坚硬,具有良好的抗腐败、侵蚀、灼烧等功能,是生物个体组织中降解缓慢、抗污染力强的结构,能够较好保护生物个体的DNA,即使其他软组织被完全腐败、碳化,在骨骼组织中仍可提取DNA检材。然而同样由于骨骼抗腐败、侵蚀的原因,相较于其他组织,骨骼的酶解消化、DNA提取和纯化难度也随之增大。笔者通过在法医物证学领域的工作和学习,分享了关于陈骨和烧骨中骨DNA的提取技术内容,以期为广大鉴定同仁、法律界人士提供参考。

  关键词:法医学,陈骨,烧骨,DNA检验

  骨是由骨组织、骨膜和骨髓等构成的坚硬器官,在机体中主要起支持、运动和保护作用,骨中含有大量钙、磷等矿物质。骨组织是骨骼的主体结构,包括骨组织细胞和骨基质。骨基质是指钙化的细胞外基质,包括有机成分和无机成分。骨组织细胞包括成骨细胞、骨细胞、破骨细胞,细胞间质主要是由胶原和羟基磷灰石构成。骨中30%是由骨细胞分泌的胶原,65%~75%则是骨骼的支撑结构羟基灰石。骨组织中骨细胞、成骨细胞和破骨细胞是骨骼DNA的主要来源。

  由于骨骼组织坚硬,具有良好的抗腐败、侵蚀、灼烧等功能,是生物个体组织中降解缓慢、抗污染力强的结构,能够较好保护生物个体的DNA,即使其他软组织被完全腐败、碳化,在骨骼组织中仍可提取DNA检材。

  提供骨骼中DNA并进行生物信息检测和比对研究,在当今考古、法庭科学领域中是一项重要的技术手段。在软组织不具有提取DNA价值时,可以考虑在骨中提取DNA。法庭科学鉴定工作中,除了在腐败尸体中提取骨DNA,还包括在陈骨和烧骨中提取DNA。然而同样由于骨骼抗腐败、侵蚀的原因,相较于其他组织,骨骼的酶解消化、DNA提取和纯化难度也随之增大。笔者通过在法医物证学领域的工作和学习,分享了关于陈骨和烧骨DNA的提取、测序要点等检验鉴定内容,以期为广大鉴定同仁、法律界人士提供参考。

陈骨和烧骨DNA提取的法医学鉴定探讨论文

  一、陈骨与烧骨

  (一)陈骨


  对于陈骨的定义,目前尚无权威的解释,主要是指年代久远的骨骼,包括掩埋多年的尸体、古代尸体、木乃伊,甚至骨化石等。对于古代尸体等陈骨的研究,主要是考古界等为了进行种群溯源或族属分类,如万诚等人[1]通过对陈骨的DNA提取和测序,获取了大量古人的遗传信息,这些DNA信息为骨样所属时代和与之有关族属的迁徙和发展,提供了丰富的研究资料。法庭科学鉴定工作中,对陈骨DNA的研究主要是为了进行个体识别。由于案发时间距离发现尸体的时间较远,尸体因环境因素腐败、白骨化,甚至骨骼被侵蚀、风化,难以辨识陈骨的个体信息,给案件侦破活动带来困难。通过对陈骨中DNA的提取和检验,可以进行个体识别。当然,也可通过对陈骨中DNA的提取和检验,进行亲缘关系鉴定,李成涛等人[2]曾报道了一起陈骨且骨骼已风化的案件,通过对陈骨与案件中可疑父母进行亲缘关系鉴定,虽然检出的基因位点较少,但仍推断出了骨样本身源者的性别,并推断不排除骨样与疑母存在亲缘关系,为侦查提供了方向。

  (二)烧骨

  在法庭科学鉴定工作中,烧骨通常是指人体中骨骼与其他组织在火灾、爆炸、焚尸等案件中,被焚烧后,残留的烧焦尸骨或残骨碎片。骨骼加热到300℃以上时,开始因为灼烧而出现长轴方向裂隙,随着温度的升高,骨骼内的有机物变性、丧失,骨骼的颜色开始由黄色向褐色、深褐色、黑色、灰白色、白色依次逐渐变化,骨骼的脆性也随之增加。烧骨可以导致有机物变性、碳化,焚烧严重者可使有机物丢失、灰化,骨组织的DNA检出率也随骨骼的被焚烧程度变化,焚烧程度越高的,骨DNA的检出率也随之降低。

  二、骨中DNA的提取

  对骨DNA的提取,无论何种方法都应当避免污染,实验室在收到骨检材后,应按实验室工作管理要求进行必要的登记和妥善保存。骨DNA提取前,首先应将骨样洗净晾干,而后进行紫外线照射,再以锯、钻、刮等方式取得骨屑或骨粉。与其他组织DNA的提取一样,骨DNA的提取同样遵循三个步骤,即第一,对材料进行细胞裂解,使其释放DNA分子;第二,细胞裂解后,将DNA分子与其他细胞物质分离;第三,将DNA提纯,并制备成可以进行聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,简称PCR)扩增等应用形式的样本。提取过程应防止样本之间、样本与外源物质之间的污染。

  目前较为成熟的骨DNA提取方法有:苯酚-氯仿法、Chelex-100法、硅珠法、硅胶膜法等,对于烧骨更加微量DNA的提取,国内学者还提出了改良苯酚-氯仿法、十六烷基三甲基溴化胺法[3]等。

陈骨和烧骨DNA提取的法医学鉴定探讨论文

  (一)苯酚-氯仿提取法

  苯酚-氯仿法是经典的DNA提取方法,广泛用于DNA测序工作中。在骨DNA提取时,采取碎骨、研磨方法取骨样,通过乙二胺四乙酸钠(Eth-ylene Diamine Tetraacetic Acid,简称EDTA)脱钙、十二烷基硫酸钠(Sodium Dodecyl Sulfate,简称SDS)去污、蛋白酶K(Proteinase K,简称PK)消化,再通过离心分离DNA方式获得样液,而后使用苯酚(phenol)和氯仿(Trichloromethane,也称三氯甲烷)进行萃取,最后获得DNA。在此过程中,使用EDTA可以螯合钙、镁等金属离子,极大减少组织被破坏,不影响DNA分子结构。

  (二)Chelex-100提取法

  Chelex-100是一种由苯乙烯和二乙烯苯共聚体组成的化学螯合树脂,内部含有成对的亚氨基二乙酸盐离子,具有非常明显的螯合多价金属离子作用。通过螯合镁离子等,使核酸酶失去活性,保护DNA分子不被降解。在骨DNA提取时,与苯酚-氯仿提取法取得样液过程相同,再通过Chelex-100提取DNA。提取过程中应始终在一个试管内进行,可有效避免污染。但由于本法提取的DNA纯度不高,所以笔者不建议运用Chelex-100法提取骨DNA。

  (三)硅珠提取法

  异硫氰酸胍(Guanidinium thiocyanate,简称GuSCN)具有裂解消化细胞且抑制核酸酶活性的作用,硅珠法是通过碎骨、研磨、EDTA脱钙、PK+GuSCN裂解消化骨中DNA,并利用硅珠在裂解介质中对DNA的特异性吸附作用,将骨DNA进行提取。刘雅诚[4]等人研究认为,硅珠法相较于Chelex-100或苯酚-氯仿法,可以明显提高骨DNA的检出率。GuSCN属于有毒物质,特别是其在遇酸后可产生有毒气体氰化氢(HCN),提取时应注意人员和环境的保护。

  (四)硅胶膜提取法

  硅胶膜法是通过挫骨、EDTA脱钙、消解获取含有骨DNA的样液,再通过快速离心柱,将DNA结合到QIAamp硅胶膜上,并过滤掉其他污染物,再通过两次洗涤,将二价阳离子和蛋白质等去除,最高得到高纯度的DNA。在取骨样时,可以挫取骨粉的方法获取,无需对骨样进行研磨,减少提取流程,是笔者比较推荐使用的方法。[5]

  (五)改良苯酚-氯仿提取法

  徐国昌等人[6]通过对苯酚-氯仿法进行改良,并运用改良后方法进行实验,研究后认为,改良方法虽然比常规方法多了3个步骤,且实验时间也较常规方法耗时长,但DNA的产率明显提高,是烧骨DNA提取工作中值得推广的方法,可以有效维护DNA分子结构。在DNA提取时,使用EDTA可以极大减少组织破坏,不影响DNA分子结构;在氯仿、异戊醇的作用下,减少酚对DNA分子结构的破坏。对于DNA样品纯度不好的,应当进行纯化处理,PCR反应物应当尽快进行电泳且体积在10ul为宜。当出现“影子带”(StutterBand,又称鬼影带),读取时应当进行严格鉴别。

  (六)十六烷基三甲基溴化铵提取法

  十六烷基三甲基溴化铵(Sixteen Alkyl Three Methyl Bromide,CTAB)是一种阳离子去污剂,能溶解细胞膜,具有从低离子强度的溶液中沉淀核酸和酸性多聚糖的特性,CTAB与蛋白质和大多数酸性多聚糖以外的多聚糖形成复合物,可以用于从大量产生黏多糖的有机体中制备纯化DNA。

  叶健等人[3]通过实验,将烧骨研磨后加入CTAB缓冲液中,室温下放置12~24h,而后加入PK,经过水浴震荡等流程使骨组织细胞释放DNA,再通过离心获取含有DNA的液体。通过磁珠纯化DNA、PCR扩增后,焚烧度较轻烧骨可以检验完整清晰的DNA图谱,焚烧度越重DNA的缺失位点越多。相较于传统苯酚—氯仿提取法,CTAB法提取陈旧骨和烧骨的DNA更加稳定、简便。

  (七)其他

  其他还有一些新型的骨DNA提取方法,如美国的Steadman等人[7]研究的,利用热离析作用协同PCR技术对烧骨DNA的提取,其实验中使用了十种化学药品,结果表明每一种处理方法都可以顺利获取DNA。

  三、结语

  法庭科学从业人员或司法鉴定人,在受理此类案件时,应对送检骨样进行初步审查,对陈骨的腐败、降解程度和烧骨的烧灼程度进行肉眼综合判断,经初步审查认为难以检出或仅可部分检出DNA序列的检材,受理审查人员应在检验前向委托方进行告知。

  陈骨和烧骨的检出率主要依靠取材和骨DNA提取过程,除了上述注意要点外,实验时还应注意防止样品污染。如,在吸加PCR试剂和模板时,吸样要慢且尽量一次性完成,避免因多次抽吸导致的交叉污染或气溶胶污染。取材料、碎骨、研磨、DNA提取等每一次操作过程要勤换手套,特别是进入不同区域、接触不同物体都要更换手套。每一项操作都要动作轻柔,避免误伤和飞溅。

  综上所述,在进行陈骨和烧骨DNA检验时,骨DNA的提取相对复杂,除了因为骨样品自身腐败、降解、烧灼碳化等原因外,骨样取材位置、DNA提取方法、实验人员经验等也会对结果造成影响,实验室应按DNA检测的质量控制程序进行结果控制。对于骨DNA的提取方法,目前仍有待专家学者们进一步研究,研制出更加方便、快捷、高效的提取方法,在法庭技术DNA检验鉴定中推广。

  参考文献

  [1]万诚,崔银秋,段然慧,等.夏家店等古人骨DNA的提取、扩增及序列分析[J].中国生物化学与分子生物学报,2001(5):636-641.

  [2]李成涛,林源,李莉.一例陈年骨骼DNA分析案件引起的反思[J].中国司法鉴定,2006(4):61,63.

  [3]叶健,季安全,赵兴春,等.烧骨DNA检验技术的研究[J]法医学杂志,2004(3):155-159.

  [4]刘雅诚,王静,严江伟,等.硅珠法提取骨组织DNA[J].中国法医学杂志,2002(1):38-40.

  [5]安志远,刘亚楠,李文灿,等.硅胶膜法用于蜡化尸体骨密质DNA检验1例[J].中国法医学杂志,2014,29(1):67-68.

  [6]徐国昌,侯续伟,任甫,等.烧骨DNA提取与检测技术的实验研究[J].中国临床解剖学杂志,2012,30(1):91-95.

  [7]STEADMAN DW,DIANTONIO LL,WILSON J J,et al.The effects ofchemical and heat maceration techniques on the recovery of nuclear andmitochondrial DNA from bone[J].J Forensic Sci,2006,51(1):11-17.

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