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二联体亲权鉴定中 STR 异常现象分析论文

发布时间:2024-01-31 10:10:20 文章来源:SCI论文网 我要评论














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  摘要:目的:针对二联体亲权鉴定中STR异常现象进行分析研究。方法:在2019年1月到2023年1月期间的2310例二联体亲权鉴定中,有34例STR出现异常现象,通过对该34例STR基因座异常现象采用AGCU EX22和YESU 21plex两种试剂盒对STR异常进行验证分析,用AGCU EX21+1试剂盒加测位点,进一步分析验证。必要时补充Y-STR或X-STR进行分析检测,确定最终检测结果。结果:在2310例二联体亲权鉴定中,有34例存在STR基因座异常现象,通过对此34例STR基因座异常现象采用YESU 21plex试剂盒复测,AGCU 21+1试剂盒加测位点进行进一步的二联体鉴定,能够确认有30例存在STR一步突变,不能排除亲子关系,4例能排除亲子关系。结论:在采用AGCU EX22试剂盒进行二联体亲权鉴定时,当鉴定结果存在STR突变时,为提高其鉴定结果的准确性,需要以不同试剂盒再进行验证分析,再进一步引入其他遗传标记进行鉴定,避免出现鉴定错误。

  关键词:短串联重复序列;基因座突变;二联体亲权鉴定

  短串联重复序列(Short Tandem Repeat,STR)属于人类遗传中的重要标记之一,在开展法医学亲子鉴定过程中其数据结果具有重要的作用,是判定两者之间是否存在血缘关系的重要遗传标记之一[1]。同时,STR相关数据对分析人体遗传病具有重要的参考价值。在进行亲子鉴定过程中STR基因座突变是一种普遍存在的现象。其中,STR基因座突变中的突变主要包括一步突变和多步突变,一步突变只涉及一个基序的增加或者减少,在STR基因座突变中发生一步突变的概率高达90%;多步突变主要是指发生多个序列突变,在STR基因座突变中发生多步突变,最多四步突变的概率为10%[2]。当STR核心序列发生突变现象时,可能会导致法医物证在进行亲子鉴定时出现误判现象。因此,在开展亲子鉴定时,要充分考虑有可能出现STR基因座突变的现象。为有效避免因STR基因座突变而导致鉴定结果不准确,本文主要对二联体亲权鉴定中STR异常现象进行分析。其中,研究报告如下:

  一、资料与方法

  (一)一般资料

  本次研究采用回顾性分析的方式,在2019年1月至2023年1月期间,对2310例STR存在一步突变的基因开展联体亲权鉴定,其中有1749例为父—子(女)二联体鉴定,561例为母—子(女)二联体鉴定,在鉴定时对每个样本采集末梢血,3μL。

  (二)方法

  1.仪器与试剂

  在本次研究中采用的仪器分别为杭州博日科技有限公司生产的TC-96扩增仪以及美国ABI 3130XL型基因分析仪。STR基因座分型试剂为中德美联生物技术有限公司生产的AGCU EX22荧光检测试剂盒和AGCU EX21+1荧光检测试剂盒,江苏苏博生物医学科技南京有限公司生产的YESU 21plex荧光检测试剂盒。

  2.检测方法

  (1)对DNA进行提取:提取所有案例中的血样DNA样本,提取方法为Chelex100快速提取法;(2)PCR扩增:利用荧光复合扩增技术,对AGCU EX22的21个STR基因座进行五色荧光标记;(3)STR基因座检测:将PCR扩增产物和去离子甲酰胺进行一定比例的混匀,采用ABI 3130XL型基因分析进行毛细管电泳分型,并收集STR基因座发出的荧光信号,采用GeneMapper ID-X软件进行基因型分析。

  3.STR突变基因座判定方法

  根据采用AGCU EX22检测试剂盒的检测结果对不符合遗传规律的样本进行筛选,同时对不符合遗传规律的样本采用YESU 21plex试剂盒进行复核,用AGCU EX21+1试剂盒加测位点获取其他基因座的遗传信息。按照二联体亲权指数(PI)判断亲子关系,对不符合遗传规律的基因座列为突变基因座。

  4.统计突变率方法

  采用直接计数法计算基因座突变率。

  (三)统计学分析

  采用国标《亲权鉴定技术规范》(GB/T 37223-2018)以及公共安全行业标准《法庭科学DNA实验室检验规范》(GA/T 383-2014),结合我国汉族人群STR基因座的等位基因频率进行对比研究[3]。

  二、结果

  (一)STR突变基因座突变率

  在本次研究分析的2310例二联体亲权鉴中,有34例存在STR基因座异常现象,其中,在这34例中21个STR突变基因座突变具体情况如表1所示:

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  (二)在其他检测方法复核下排除案例STR突变基因座信息

  在本次研究中,通过对34例STR基因座异常现象采用YESU 21plex试剂盒进行复核,用AGCU EX21+1试剂盒进行进一步的二联体鉴定,能够确认其中有30例存在STR一步突变,不能排除亲子关系,4例能排除亲子关系。其中,排除案例STR突变基因座信息如表2所示:

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  三、讨论

  短串联重复序列具有多态性,能够较快对个体进行识别,且检测方法具备简便、快捷等特点,在目前已经成为亲子鉴定中最常采用的方法。在亲子鉴定中常见的方法包括三联体鉴定和二联体鉴定,三联体鉴定主要是对父—母—子(女)进行鉴定,二联体鉴定主要是通过父(母)—子(女)进行鉴定,其中在二联体鉴定中由于缺少其中一方亲代遗传的相关信息,导致在鉴定过程中可能会发生STR基因座突变现象,从而导致亲子鉴定结果的准确性受到一定的影响[4]。近年来,亲子鉴定的案例呈现出逐年递增的情况,在开展亲子鉴定工作过程中采用二联体亲子鉴定的比例越来越高。由于在进行二联体鉴定时只需要其中一方亲属参与鉴定,导致在鉴定过程中无法获取另一方的遗传信息,从而导致STR基因座检测的效率降低,会出现一定的异常现象。目前在开展二联体鉴定时,主要采用21个STR基因座进行检测,但是在检测过程中会存在一定的风险现象,即可能发生漏排非父风险,因此为了能够有效提高二联体鉴定的准确性,在开展二联体鉴定过程中就要增加具有高多态性、稳定性良好的遗传标记进行检测[5]。

  所谓的突变主要是建立在认定亲权关系假设成立的基础上,一般而言STR基因座突变与遗传多态性有一定联系,STR基因座发生突变主要是由于复制滑动。当出现复制滑动现象时,STR基因座等位基因重复单位会出现增加或者减少的情况,一般情况下序列结构比较均一的基因座更加容易出现基因突变现象。同时,在等位基因中,当含有不完全序列的基因座时发生突变的概率反而比较低,反观扩增片段较为明显的STR基因座反而更加容易出现突变情况,出现这种情况的原因主要是重复单位较多的基因座长度更长,导致多态性程度也更多,从而会增加STR基因座突变的概率。此外,STR基因座等位基因突变和性别有一定联系,源于父亲的基因突变比源于母亲的基因突变更加明显,其原因在于基因突变率和细胞分裂次数有关,男性的精原细胞会经过多次分离才会形成精子,分裂次数大于女性卵原细胞分裂,导致DNA复制时出现滑动错配情况就更多,使得STR基因座突变概率增加。

  本次研究中,在21个STR基因座基础上采用多种STR基因座复合扩增体系进行检测,在一步突变中,STR基因座不符合相关遗传规律的案例进行分析,采用多种STR基因座复合扩增体系能够有效提高亲子鉴定的效率。在检测过程中,当确定一个STR基因座出现突变现象时,就要采用不同的基因检测系统进行复核,采用不同引物基因座进行检测,能够尽可能避免因为引物结合区变异而出现的等位基因假突变现象,也就是学术中所指出的等位基因丢失。在采用AGCU EX22试剂盒检测时,可能会存在一定的风险现象,发生漏排非父风险,因此在检测过程中引入YESU 21plex试剂盒、AGCU EX21+1试剂盒系统进行二联体鉴定时,能够有效确保检测的准确性。在采用YESU 21plex试剂盒检测过程中,能够起到与AGCU EX22试剂盒相同的作用,有效对AGCU EX22试剂盒结果进行复核,从而排除在检测过程中发生STR基因座异常现象。

  在本次研究中,分析STR基因座的突变率时通过对2310例进行二联体亲权鉴定,采用常规的AGCU EX22试剂盒检测时,共有34例存在STR基因座异常现象,突变率在0.04%~0.22%之间,在研究中发现,PentaD、D21S11突变率较高,一般而言在亲权鉴定中,计算遗传标记STR的总突变率时一般不能高于0.2%,而在本次研究中PentaE、FGA的基因座突变率较高,因此在开展法医物证鉴定过程中要注意相关基因的突变问题,为避免基因突变率较高导致法医物证鉴定结果不准确等,要采用其他辅助方式进行鉴定,从而有效降低误判风险。在本次研究中,虽然开展了多个基因座检测,但是基因座之间存在一定的连锁不平衡情况,在开展研究时群体遗传学数据有限,所检测的结果只能当作研究参考。

  综上所述,在进行亲权鉴定时,在检测过程中,要注意发生STR基因座异常的情况。通过检测遗传标记能够有效判断认定亲权关系,但是也要注意发生STR基因座突变现象。通过多种PCR试剂盒检测,在AGCU EX22试剂盒检测基础上开展YESU 21plex试剂盒、AGCU EX21+1试剂盒检测,能够相互证实突变结果,必要时,需要补充Y-STR或X-STR进行分析检测,能够有效对亲权关系进行综合判断,从而有效排除各种干扰因素,避免发生错误判断的现象,提高鉴定效率,得到科学、全面、可靠的鉴定结果。因此,开展二联体亲权鉴定中STR异常现象分析在法医物证工作中具有推广和应用意义。

  参考文献

  [1]何丽仪,车志文.亲子鉴定中STR基因座的等位基因丢失分析与解决对策[J].医学与法学,2022,14(3):98-102.

  [2]李海霞,陈延冰.母系突变的亲子鉴定1例[J].广东公安科技,2021,29(4):69-71.

  [3]刘志勇,任贺,陈冲,等.基于有限突变模型和大规模数据的19个常染色体STR的实际突变率研究[J].遗传,2021,43(10):949-969.

  [4]杨飞,董露斌.STR基因座突变对亲子鉴定准确性的影响研究[J].法制博览,2021(19):115-116.

  [5]兰菲菲,丁红珂,陈延冰,等.亲子鉴定中STR基因座来源不明突变的分析[J].检验医学,2021,36(2):185-189.

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