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(1)综合归纳法
综合归纳法是一种从特殊到一般的论证方法。它是人们在知道许多具体客观事物的特殊性质后，从众多有代表性的个案中总结出总体事物的一般规律，进而总结出一般原理和结论的一种证明方法。采用这种方法，要特别注意调查研究，占用大量资料，而且资料要真实可靠。根据材料的内容，可以采用：完全归纳推理；简单的枚举归纳推理；归纳推理，阐明现象的因果关系。运用其中一种推理方法进入深入分析，把握其本质，找出其普遍规律，进而得出正确的结论。
(2)反驳与证明
无论反证法都是一种简略的论证方法。对同一个具体事物的不同理解，是由于不同的作者或研究者对问题持有不同的论点和态度而造成的。在这种情况下，作者往往会在论证的基础上，提出与自己理解不同的论点，然后采用陈述事实的方法进行推理，对自己的不同论点进行批判或揭露，提出自己的主张。
(3)比较分析法
比较分析是一种从个体到个体的论证方法。在医学SCI论文的写作中，根据SCI论文的内容和具体要求，往往采用文本语言，将两个具体事物各自的特点清晰准确地描述出来进行分析比较，并采用比较分析的方式进行论证。在医学SCI论文的写作中，用的最多的是设计各种图表进行对比分析，让读者一目了然。
(4)演绎推导法
演绎是一种从一般到特殊的论证方法。它是利用有关的科学理论或理论，如人们已经知道的许多具体事物的共同属性和本质等，推论出某些尚未深入研究的个别事物和问题的独特本质或特征的一种论证方法。演绎法由三个判断组成：一是用来提出和分析问题的一般原则，称为大前提；另一个是被分析的事物及其在某一方面的属性，称为小前提；首先是表达得出的结论。使用演绎推理的关键是大前提必须正确，而且大前提和小前提之间要有必然联系。如果前提不成立，即使推理合乎规律，也不能得出正确的结论。
论证的目的在于揭示论证与论证之间的逻辑关系。具体采用何种论证方式，根据SCI论文的具体内容和写作要求来确定。论证的过程就是逻辑推理的过程。论证的意义和作用是揭示论证与证据之间的必然联系，从论证中证明论证的必然性。
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