中科院分区和JCR分区是
SCI期刊分区的两类分区，两类分区都是有科学依据的，都是将SCI 期刊分为四个区，那么中科院二区和SCI 二区差别是什么?首先，二者都是按照期刊影响因子分区的，但是在学科划分、分区标准、指标取值上是不同的。
影响因子，英文：Impact Factor，简称IF，是汤森路透（Thomson Reuters）出品的期刊引证报告（Journal Citation Reports，JCR）中的一项数据，即某期刊前两年发表的论文在该报告年份（JCR year）中被引用总次数除以该期刊在这两年内发表的论文总数，是国际上通行的期刊评价指标。
通俗地讲，影响因子就是衡量期刊质量和影响力大小的评价指标，一般影响因子越高，期刊越好。而SCI的两种分区都是基于SCI收录的期刊影响因子基础之上进行的。
中科院分区影响因子6% -20% 为二区期刊，JCR分区25-50%(含50%)为Q2区，所以不仅仅是影响因子取值不同，连称谓也是有区别的，中科院的分区呈金字塔样，一区期刊是数量最少的，越靠后的分区，
期刊数量越多，而JCR分区就比较平均，每个区期刊数量几乎一致约为25%。
中科院分区是将JCR中所有期刊分为数学、化学、生物、地学、天文、工程技术、医学、环境科学、农林科学、社会科学、管理科学以及综合性期刊13大类，然后按照各类期刊影响因子分别将每个类别划分为以下4个区：前5%的期刊为1区，6%-20%的期刊为2区，21%-50%的期刊为3区，剩下的就是4区期刊。
这样的分区区别会出现一种情况，同一刊物在两种分区标准中所处的分区会不同，比如某个刊物在JCR分区是一区期刊，到了中科院分区中可能就是二区期刊了，这种情况让不少作者不免担心，选择期刊时究竟按照哪一种分区标准?两种分区都是科学适用的，主要看作者单位和学校适用于哪一种标准。
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